期刊简介

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  • 杂志名称:中国病原生物学杂志
  • 主管单位:中国寄生虫病防治杂志
  • 主办单位:中华人民共和国卫生部
  • 国际刊号:11-5457/R
  • 国内刊号:11-5457/R
  • 出版周期:月刊
期刊荣誉:中华预防医学会、系列杂志优秀期刊期刊收录:上海图书馆馆藏, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中), 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 万方收录(中), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版)
中国病原生物学杂志2012年第03期

北京市西城区手足口病柯萨奇病毒A5型VP4区基因特征分析

吉彦莉;王永全

关键词:手足口病, 柯萨奇病毒A5型, VP4区, 进化分析
摘要:目的 分析2009年北京市西城区手足口病柯萨奇病毒A5型(CoxA5)的VP4区基因特征,了解其变异情况.方法 采集手足口病患儿咽试子,提取病毒RNA,用肠道病毒VP4区分型引物进行半巢式RT-PCR(RT-nPCR),通过测序和GenBank Blast比对确定肠道病毒型别,并对其VP4区进行序列和进化分析. 结果 共鉴定出5株CoxA5,GenBank登录号为JN981017- JN981021.在VP4区,5株CoxA5与中国株HQ728261核苷酸及氨基酸序列同源性分别为96%~99%和98%~100%.进化分析表明,5株CoxA5与中国株HQ728261遗传距离为0.005~0.045,共同构成一个独立的进化树分支.5株CoxA5在VP4区无氨基酸的缺失和插入,未发现特有的氨基酸置换. 结论 2009年北京市西城区手足口病病原体CoxA5VP4区与中国株HQ728261在进化上密切相关,其序列未发生明显变异.