期刊简介

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  • 杂志名称:中国病原生物学杂志
  • 主管单位:中国寄生虫病防治杂志
  • 主办单位:中华人民共和国卫生部
  • 国际刊号:11-5457/R
  • 国内刊号:11-5457/R
  • 出版周期:月刊
期刊荣誉:中华预防医学会、系列杂志优秀期刊期刊收录:上海图书馆馆藏, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中), 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 万方收录(中), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版)
中国病原生物学杂志2014年第11期

龙岩市手足口病病原体柯萨奇B5病毒基因特征分析

廖琳虹;何云;陈前进;曹春远;吴水新;张彦锋;何春荣

关键词:手足口病, 柯萨奇病毒B5, VP1区, 种系分析
摘要:目的 了解龙岩市手足口病病原体柯萨奇B5病毒(Coxsackie virus B5,CVB5) VP1区基因特征及变异情况.方法 对2011年采自确诊手足口病患者的Real-time RT-PCR法检测肠道病毒通用引物阳性而肠道病毒71型(enterovirus 71,EV 71)和柯萨奇病毒A16型(Coxsackie virus A 16,CVA16)阴性未分型样品,经RD细胞分离肠道病毒.从培养上清中提取RNA核酸,经RT-PCR法初步鉴定病毒型别.应用187/222引物对扩增病毒株的VP1区,回收产物经克隆、筛选后测序.采用ClustalX、Mega5.0进行核苷酸及氨基酸序列同源性分析和进化树构建. 结果 104份未分型样品中分离到3株CVB5.3株CVB5分离株VP1区长度为330~357个核苷酸,编码110~119个氨基酸.3株间的核苷酸同源性为97%~99%,氨基酸同源性为84%~99%.比较推导的氨基酸序列,FJLY2011126h株VP1与另外2株龙岩分离株相比有18个位点差异,核苷酸序列287~288位发生插入突变,第290、291、338、339位发生颠换,与2010年长春株JN695051的同源性高(核苷酸同源性95%~98%,氨基酸同源性84%~99%). 结论 2011年福建省龙岩市手足口病患者中存在CVB5感染,病毒与2005年法国株和国内山东、长春、昆明、浙江病毒株属同一型别.