期刊简介

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  • 杂志名称:中国病原生物学杂志
  • 主管单位:中国寄生虫病防治杂志
  • 主办单位:中华人民共和国卫生部
  • 国际刊号:11-5457/R
  • 国内刊号:11-5457/R
  • 出版周期:月刊
期刊荣誉:中华预防医学会、系列杂志优秀期刊期刊收录:上海图书馆馆藏, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中), 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 万方收录(中), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版)
中国病原生物学杂志2015年第11期

柯萨奇病毒A6 TaqMan探针实时荧光逆转录PCR检测方法的建立

李洋;张相萍;翟明强;黄学勇;李懿

关键词:手足口病, 肠道病毒, 柯萨奇病毒A6, 实时荧光PCR
摘要:目的 设计柯萨奇病毒A6特异性TaqMan探针和引物,建立敏感、特异的实时荧光逆转录PCR检测方法.方法 针对CVA6 VP1基因,设计荧光探针和引物,优化摩尔配比,建立并优化PCR反应体系.回收PCR产物,构建重组质粒,经梯度稀释后作为模板进行敏感性试验,绘制标准曲线,评估检测方法的敏感性.对包括多种肠道病毒在内的共15种病毒进行特异性实验,评估检测方法特异性.对479份手足口病患者临床标本进行鉴定,检出的CVA6阳性标本再用普通PCR方法复核.随机抽取10份实时荧光PCR阳性产物克隆后测序,评估本方法检测临床标本的准确性.结果 建立的实时荧光逆转录检测方法扩增出CVA6 VP1基因的目的序列,当探针、引物摩尔配比在1:2~1:5时,PCR结果均较为理想,探针、引物摩尔配比为1:3.5时,荧光强度大.敏感性试验显示该方法扩增效率为88.9%,可检出低至2.1×102copies/ml核酸模板.特异性试验显示该方法仅能对CVA6实现特异性扩增,其他多种病毒反应均为阴性.从479份手足口临床标本中共检出CVA6阳性标本84份,与普通PCR方法复核结果一致.随机抽取的10份阳性产物克隆测序鉴定后均为CVA6目的序列.结论 建立的实时荧光逆转录PCR方法具有特异性强、灵敏度高、准确可靠等优点,可用于CVA6型手足口病检测.