期刊简介

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  • 杂志名称:中国病原生物学杂志
  • 主管单位:中国寄生虫病防治杂志
  • 主办单位:中华人民共和国卫生部
  • 国际刊号:11-5457/R
  • 国内刊号:11-5457/R
  • 出版周期:月刊
期刊荣誉:中华预防医学会、系列杂志优秀期刊期刊收录:上海图书馆馆藏, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中), 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 万方收录(中), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版)
中国病原生物学杂志2016年第07期

河南省濮阳市7株肠道病毒71型全基因组序列分析

徐国锋;王瑞;张清杰;张玉华;孟晓飞;隋美丽;李懿;卫海燕;黄学勇

关键词:肠道病毒71型, 全基因测序, 系统发育
摘要:目的 了解濮阳地区手足口病患者标本中分离的肠道病毒71型(EV71)病毒全基因组特征. 方法 选取本市发生的7例手足口病患者肠道病毒EV71型核酸阳性标本,使用人横纹肌肉瘤细胞(rhabdomyosarcomcell,RD)进行病毒培养,RT-PCR型别鉴定,对分离的7株EV71型毒株通过12对引物进行分段扩增,扩增产物进行EV71型全基因组序列测定和基因进化特性分析,利用生物信息学软件对基因组序列进行分析并构建EV71病毒分类和发育图谱.结果 共分离出7株EV71病毒,系统发育树显示7株病毒在分类上均属于C4亚型C4a分支.在发育相似度上主要分为两大类,其中PY464与宁波2010年NINGBO.CHN/065/2010 EV71分离株相似度高;其他6株呈现聚类,与山东临沂EV71 SDLY107分离株相似度高.在同一时期、同一地区,轻、重症病例分离株VP1区段无明显差别,而全基因x段存在一定差别. 结论 在濮阳市同一地区、同一时期,亦呈现出以某一种手足口病病毒为主的流行趋势.