期刊简介

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  • 杂志名称:中国病原生物学杂志
  • 主管单位:中国寄生虫病防治杂志
  • 主办单位:中华人民共和国卫生部
  • 国际刊号:11-5457/R
  • 国内刊号:11-5457/R
  • 出版周期:月刊
期刊荣誉:中华预防医学会、系列杂志优秀期刊期刊收录:上海图书馆馆藏, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中), 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 万方收录(中), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版)
中国病原生物学杂志2016年第06期

结核分枝杆菌higB基因的扩增及生物信息学分析

董娜;刘丹;付玉荣;伊正君

关键词:结核分枝杆菌, higB, 扩增, 生物信息学分析
摘要:目的 扩增结核分枝杆菌(H37Rv)的higB基因,运用生物信息学方法预测其编码蛋白的生物信息学特征.方法 采用PCR方法扩增higB基因并对扩增产物测序,通过在线Protparam、protscale、SignaIP 4.1、Motif Scan、SWISS_MODEL等程序,分析higB基因编码蛋白的生物学特征. 结果 获得的higB基因全长378 bp,与预期大小基本一致,基因序列与GenBank上公布的MTB标准株的核苷酸同源性为100.00%.higB蛋白共125个氨基酸,分子质量单位为14.429 8 ku,理论等电点10.18,脂溶性系数77.36,不稳定系数35.67,预测该蛋白为稳定蛋白.higB蛋白无信号肽,其二级结构中β-转角占12%,无规则卷曲占34.4%,氨基酸序列中有3个潜在的B细胞抗原表位,4个Th细胞表位,5个磷酸化位点. 结论 成功扩增了结核分枝杆菌higB基因,通过生物学信息获得了其编码蛋白的信息学特征,为研究该蛋白的生物学功能和免疫活性奠定了基础.