期刊简介
本刊坚持以马克思主义、毛泽东思想为指导，遵循党的基本路线，贯彻理论与实践相结合，普及与提高相结合，“百花齐放，百家争鸣”的方针，坚持面向科研、教学、临床和防治，充分反映我国病原生物学的研究水平，促进我国病原生物学事业的发展。
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首页>中国病原生物学杂志
- 杂志名称：中国病原生物学杂志
- 主管单位：中国寄生虫病防治杂志
- 主办单位：中华人民共和国卫生部
- 国际刊号：11-5457/R
- 国内刊号：11-5457/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：中华预防医学会、系列杂志优秀期刊期刊收录：上海图书馆馆藏, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中), 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 万方收录(中), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版)
新城疫病毒HBNU/LSRC/F3株HN基因的克隆及生物信息学分析
李冠华；马媛媛；王静；武彩霞；刘进军；刘开扬
关键词：HN蛋白, 生物信息学, 主要特性, 抗肿瘤
摘要：目的 克隆新城疫病毒HBNU/LSRC/F3株的血凝素神经氨酸酶蛋白(HN)基因,同时应用生物信息学工具分析其编码蛋白的主要特性. 方法 根据HN基因开放阅读框设计引物,提取新城疫病毒总RNA,通过逆转录PCR(RT-PCR)扩增HN基因,并将其连接到克隆载体上,利用蛋白分析专家系统(ExPASy)提供的ProtParam、Protscale、TMpred、Coil、MotifyScan、SWISS-MODEL等,NCBI上的CONSERVE DOMON、SMART、Signal P4.0、Bepipred 1.0、NetCTL等以及Bcepred、ABCpred、SOPMA、SYFPEITHI等生物信息学在线分析程序,结合PSORT Ⅱ Prediction、rasmol等生物信息学软件,分析、预测其编码HN蛋白的主要特性及T/B细胞抗原表位等. 结果 HN基因RT-PCR扩增产物与预期大小一致,并成功连接到克隆载体上,测序结果显示HN基因序列与GenBank上已发表的序列完全一致.其编码蛋白由571个氨基酸组成,分子式为C2766H4316N752O852S24,分子质量单位为62.5 ku,等电点理论值为6.24.HN蛋白为跨膜蛋白,富含无规则卷曲(Cc)和α-螺旋(Hh),其主要定位在线粒体和胞质中.该蛋白共有12个亲水性较高区域(参数得分≥1.9),17个表面可及性较高区域(参数得分≥1.9),9个柔韧性较高区域(参数得分≥2.0),36个翻译后修饰位点,17个潜在的B细胞表位,12个CTL表位和辅助性T细胞的联合表位. 结论 成功克隆了HN基因并分析了其编码蛋白的主要特性,为后期HN蛋白的分子克隆及其抗肿瘤特性研究奠定了基础.
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