期刊简介

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  • 杂志名称:中国病原生物学杂志
  • 主管单位:中国寄生虫病防治杂志
  • 主办单位:中华人民共和国卫生部
  • 国际刊号:11-5457/R
  • 国内刊号:11-5457/R
  • 出版周期:月刊
期刊荣誉:中华预防医学会、系列杂志优秀期刊期刊收录:上海图书馆馆藏, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中), 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 万方收录(中), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版)
中国病原生物学杂志2016年第04期

结核分枝杆菌MT3876蛋白的生物信息学分析

路晓红;付玉荣;伊正君

关键词:MT3876, 结核分枝杆菌, 结构, 功能, 生物信息学
摘要:目的 应用生物信息学分析软件预测结核分枝杆菌MT3876基因编码的蛋白质结构和功能. 方法 从NC-BI数据库获取MT3876基本的基因信息;应用ProParam预测MT3876蛋白的理化性质;应用SignalP 4.0及TMHMM分析其信号肽及跨膜区;利用在线分析Expasy工具分析蛋白二级结构并建立蛋白的三级结构模型;利用ABCpred、SYFPEITHI及NetMHCIIpan 3.1 Server分析蛋白抗原表位,寻找佳B细胞及T细胞抗原位点. 结果 MT3876编码结核分枝杆菌假想蛋白MT3876具有172个氨基酸残基.该蛋白无信号肽,位于胞壁,跨膜结构不明显.二级结构中无规卷曲约占52.33%,结构疏松.MT3876具有潜在的B细胞抗原表75~90、103~118、17~32、140~155、96~113、123~142及37~54等位点,T细胞抗原表位1~10、80~88、114~118、133~141及149~172等. 结论 生物信息学预测MT3876基因编码的蛋白质具有潜在的B、T细胞抗原表位,可作为研发免疫诊断方法的侯选分子靶标.