期刊简介

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  • 杂志名称:中国病原生物学杂志
  • 主管单位:中国寄生虫病防治杂志
  • 主办单位:中华人民共和国卫生部
  • 国际刊号:11-5457/R
  • 国内刊号:11-5457/R
  • 出版周期:月刊
期刊荣誉:中华预防医学会、系列杂志优秀期刊期刊收录:上海图书馆馆藏, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中), 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 万方收录(中), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版)
中国病原生物学杂志2017年第12期

淮南市手足口病病毒分离株VP1基因分子特征分析

刘江;史永林;曾凡荣;余寿杰;魏志军

关键词:手足口病, EV71, CVA16, CVA10, VP1, 分子特征
摘要:目的 了解淮南市手足口病病毒分离株VP1基因遗传特征及进化关系. 方法 用人横纹肌肉瘤(rhabdomyosarcoma,RD)细胞对2014-2016年荧光PCR检测为EV71型、CA16型及CA10型阳性标本进行病毒分离,经2代接种出现细胞病变(CPE)后取培养物上清,提取病毒RNA,RT-PCR法扩增不同基因型VP1基因并测序,采用Bioedit5.0.6、DNAstar7.1和Mega 6.06生物软件对测序结果进行比对及进化分析. 结果 11株EV71型分离株VP1编码区的核苷酸片段长度为891nt,同源性为93.5%-100.0%,氨基酸同源性为98.3%-100.0%;7株CVA16型分离株VP1编码区的核苷酸片段长度为891nt,同源性为95.1%-97.0%,氨基酸同源性为98.7%-100.0%;3株CVA10型分离株VP1编码区的核苷酸片段长度为894nt,同源性为96.5%-100.0%,氨基酸同源性则为98.7%-100.0%.系统进化分析EV71型淮南株与安徽阜阳、山东、河南、北京、云南分离毒株亲缘性较近,处于进化分支C4a,核苷酸同源性为93.5%-100.0%,氨基酸同源性为98.7%-100.0%;CVA16型淮南株为B1b亚型,与山东株、河南株、深圳株、南京株亲缘关系较近,核苷酸序列同源性为95.1%-99.1%,氨基酸序列同源性98.7%-100.0%;CVA10淮南株处于D分支内,与云南、河南、河北株亲缘关系较近,核苷酸序列同源性为96.5%-100.0%,氨基酸序列同源性98.3%-100.0%. 结论 淮南市2014-2016年流行的EV71为C4a亚型,CVA16为B1b亚型,CVA10处于D聚类分支,与国内其他地区流行的手足口病毒亚型一致.