期刊简介
本刊坚持以马克思主义、毛泽东思想为指导，遵循党的基本路线，贯彻理论与实践相结合，普及与提高相结合，“百花齐放，百家争鸣”的方针，坚持面向科研、教学、临床和防治，充分反映我国病原生物学的研究水平，促进我国病原生物学事业的发展。
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首页>中国病原生物学杂志
- 杂志名称：中国病原生物学杂志
- 主管单位：中国寄生虫病防治杂志
- 主办单位：中华人民共和国卫生部
- 国际刊号：11-5457/R
- 国内刊号：11-5457/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：中华预防医学会、系列杂志优秀期刊期刊收录：上海图书馆馆藏, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中), 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 万方收录(中), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版)
基于rDNA靶向测序和鸟枪法测序相结合的致病菌筛查
何鮦鮦；孙强；范航；裴广倩；王媛媛；安小平；米志强；张湘莉兰；黄勇；童贻刚
关键词：rDNA靶向测序, 鸟枪法测序, 组合策略, 病原体检测
摘要：目的 基于高通量测序技术,建立靶向测序和鸟枪法测序相结合的致病菌筛查方法,以期用于临床感染标本中可疑致病菌的快速检测.为临床治疗提供参考. 方法 通过计算机模拟建立分析策略并研究其可行性,然后通过已知细菌进行验证;应用该方法对临床样品进行检测,分析样品中可疑的致病菌. 结果 在计算机模拟分析的四组标本中,相对应的细菌种属的reads检出比例在总细菌reads数中均为高.在用已知细菌进行验证的结果中,四种细菌相对应的属reads比例均达到标本总reads数的88％以上,种reads比例均达到标本总reads数的51％以上;三个真菌标本中相对应的真菌属reads比例均达到标本总reads数的91 ％以上,种reads比例均达到标本总reads数的40％以上.四个细菌样本和三个真菌样本相对应的细菌和真菌属reads和种reads检出比例分别是对应样本中含量高的属和种,与实际操作的细菌投入量基本相符.计算机模拟分析和用已知细菌测试结果表明,利用16S/ITS全长序列扩增产物进行打断建库可用于细菌和真菌的检测.将rDNA靶向测序和鸟枪法测序相结合,在临床脑脊液中检出红球菌和假单胞菌,在血液和唾液中检出金黄色葡萄球菌. 结论 靶向测序提高了检测的灵敏性,rDNA靶向测序和鸟枪法测序结果相互印证,提高了病原体检测的准确性.两种测序方法相结合用于病原体检测更加合理有效.
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