期刊简介

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  • 杂志名称:中国病原生物学杂志
  • 主管单位:中国寄生虫病防治杂志
  • 主办单位:中华人民共和国卫生部
  • 国际刊号:11-5457/R
  • 国内刊号:11-5457/R
  • 出版周期:月刊
期刊荣誉:中华预防医学会、系列杂志优秀期刊期刊收录:上海图书馆馆藏, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中), 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 万方收录(中), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版)
中国病原生物学杂志2017年第09期

结核分枝杆菌AccD5蛋白的生物信息学分析

车纾慧;付玉荣;伊正君

关键词:结核分枝杆菌, AccD5蛋白, 生物信息学, 分析
摘要:目的 应用生物信息学软件预测结核分枝杆菌AccD5基因编码蛋白的结构和功能. 方法 从NCBI数据库获取AccD5基本的基因信息;应用ProtParam软件预测AccD5蛋白的理化性质;利用SignaIP 4.1和TMHMM分析其信号肽和跨膜区;利用在线分析Expasy工具分析蛋白二级结构,建立蛋白三级结构模型;利用BepiPred l.0 Server和SYFPEITHI分析蛋白的B细胞及T细胞抗原表位. 结果 AccD5蛋白共548个氨基酸,分子式为C2621 H4153 N727 O810 S17,分子质量单位(Mr)为59.354 2×103,理论等电点为5.19,脂溶性系数为91.15,不稳定性指数为31.21,亲水性平均系数为-0.16,预测该蛋白为稳定性亲水性蛋白;二级结构中α-螺旋、β-转角、β-折叠、无规则卷曲分别占37.23%、10.58%、22.81%和29.38%,预测的B细胞、CTL细胞抗原表位分别为14个和25个. 结论 生物信息学分析AccD5为稳定蛋白,含有潜在的B、T细胞抗原表位,为研发治疗结核新药提供了潜在靶标.