期刊简介

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  • 杂志名称:中国病原生物学杂志
  • 主管单位:中国寄生虫病防治杂志
  • 主办单位:中华人民共和国卫生部
  • 国际刊号:11-5457/R
  • 国内刊号:11-5457/R
  • 出版周期:月刊
期刊荣誉:中华预防医学会、系列杂志优秀期刊期刊收录:上海图书馆馆藏, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中), 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 万方收录(中), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版)
中国病原生物学杂志2017年第08期

结核分枝杆菌Rv2629基因编码蛋白的生物信息学分析

张静静;付玉荣;伊正君

关键词:结核分枝杆菌, Rv2629, 利福平, 生物信息学分析
摘要:目的 应用生物信息学方法分析结核分枝杆菌Rv2629基因编码蛋白的结构和功能. 方法 从NCBI GenBank中获得结核分枝杆菌H37Rv利福平敏感菌株Rv2629的基因序列,利用在线分析软件预测和分析其编码蛋白的理化性质和亲疏水性,跨膜结构域及信号肽,糖基化位点及磷酸化位点,二级和三级结构及B、T淋巴细胞抗原表位. 结果 Rv2629蛋白由374个氨基酸组成,具有亲水性,主要存在于细胞壁及细胞膜.Rv2629含有信号肽及跨膜结构域,6个糖基化位点和4个磷酸化氨基酸位点,二级结构中α螺旋约占45.72%,β折叠约占17.11%.该蛋白含有3个潜在的B细胞抗原表位,其优势抗原表位主要集中在67-70,91-95,229-232位氨基酸,4个CTL细胞表位分别位于279、283、98、346位氨基酸,11个Th细胞表位分别位于26、127、256、25、34、116、204、215、350、363、367位氨基酸. 结论 Rv2629蛋白存在于细胞壁及细胞膜,是一分泌蛋白,在结核病的潜伏期可上调表达.该蛋白含有B、T细胞抗原表位,可作为结核利福平耐药株的研究靶点.