期刊简介
本刊坚持以马克思主义、毛泽东思想为指导，遵循党的基本路线，贯彻理论与实践相结合，普及与提高相结合，“百花齐放，百家争鸣”的方针，坚持面向科研、教学、临床和防治，充分反映我国病原生物学的研究水平，促进我国病原生物学事业的发展。
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首页>中国病原生物学杂志
- 杂志名称：中国病原生物学杂志
- 主管单位：中国寄生虫病防治杂志
- 主办单位：中华人民共和国卫生部
- 国际刊号：11-5457/R
- 国内刊号：11-5457/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：中华预防医学会、系列杂志优秀期刊期刊收录：上海图书馆馆藏, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中), 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 万方收录(中), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版)
人乳头瘤病毒16型E7蛋白的生物信息学分析
丛盛日；林晓瑞；任雪文；王雪莲
关键词：人乳头瘤病毒, E7蛋白, 抗原表位, 生物信息学
摘要：目的 应用生物信息学预测分析人乳头瘤16型病毒(human papillomavirus type 16,HPV16) E7蛋白的结构特征与抗原表位. 方法 自NCBI GENE BANK获取HPV16E7蛋白的基因信息,应用ProtParam分析其编码的E7蛋白理化性质和一级结构;利用SO)PMA分析E7蛋白的二级结构;应用 SWISS MODEL的Automated mode预测E7蛋白的三维空间结构;使用NetNGlyc 1.0 Server、NetPhos3.1Server、MotifyScan、SignalP及TMHMM预测蛋白质的翻译后修饰位点、信号肽切割位点和跨膜区;利用CLUSTALX将HPV16 E7蛋白同其他高危型HPV E7蛋白进行同源性对比;应用ABCpred、BepiPred、IEDB、SYFPEITHI和NetMHCIIpan 3.1 Server预测E7蛋白的优势抗原表位. 结果 生物信息学预测E7蛋白无规卷曲占52.04％,结构较松散,为不稳定性蛋白.该蛋白存在多个磷酸化位点.利用序列匹配度为46％的HPV45E7蛋白为模板得到同型二聚体三级预测结构.E7蛋白高度保守,且具有潜在的B细胞抗原表位1-8、15-22、33-46,CD8+T细胞抗原表位82-90、11-19、7-11、85-93、13-21和CD4+T细胞抗原表位9-23、73-87、10-24、7-21、21-35. 结论 HPV16 E7蛋白为不稳定蛋白.该蛋白高度保守,且具有潜在的B、T细胞抗原表位.
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