期刊简介
本刊坚持以马克思主义、毛泽东思想为指导，遵循党的基本路线，贯彻理论与实践相结合，普及与提高相结合，“百花齐放，百家争鸣”的方针，坚持面向科研、教学、临床和防治，充分反映我国病原生物学的研究水平，促进我国病原生物学事业的发展。
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首页>中国病原生物学杂志
- 杂志名称：中国病原生物学杂志
- 主管单位：中国寄生虫病防治杂志
- 主办单位：中华人民共和国卫生部
- 国际刊号：11-5457/R
- 国内刊号：11-5457/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：中华预防医学会、系列杂志优秀期刊期刊收录：上海图书馆馆藏, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中), 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 万方收录(中), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版)
结核分枝杆菌panD蛋白功能预测及生物信息学分析
伊星昊；张德峰；付玉荣
关键词：结核分枝杆菌, panD, 抗原表位, 耐药, 生物信息学
摘要：目的 研究结核分枝杆菌panD(Rv3601c)基因及其编码蛋白的结构和功能,为耐药结核的治疗提供参考依据.方法 运用ClustalX 2.1、MEGA 6.06软件以及ExPASy、NCBI等在线工具分析结核分枝杆菌panD基因信息,同时分析其进化特征、编码蛋白质的理化性质、信号肽、磷酸化位点、结构特点并预测其功能;利用BepiPred 1.0 Server和NetMHCIIpan 3.1 Server预测panD蛋白的B细胞和T细胞抗原表位. 结果 结核分枝杆菌panD基因全长420 bp,不同菌株panD基因序列相似度100％,具有高度同源性,进化关系较近,编码139个氨基酸.panD蛋白不稳定系数为8.72,亲水性平均系数为0.147,为稳定、疏水性蛋白、无跨膜区与信号肽,存在9个磷酸化位点.二级结构中以无规则卷曲为主,结构较疏松.三级结构同源建模成功.该蛋白具有多个潜在的B细胞抗原表位和T细胞抗原表位. 结论 panD蛋白作为脱羧酶,在结核分枝杆菌合成β-丙氨酸过程中具有重要作用.panD蛋白序列保守稳定,具有多个优势抗原表位,是治疗耐药结核的潜在新靶标.
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