期刊简介
本刊坚持以马克思主义、毛泽东思想为指导，遵循党的基本路线，贯彻理论与实践相结合，普及与提高相结合，“百花齐放，百家争鸣”的方针，坚持面向科研、教学、临床和防治，充分反映我国病原生物学的研究水平，促进我国病原生物学事业的发展。
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首页>中国病原生物学杂志
- 杂志名称：中国病原生物学杂志
- 主管单位：中国寄生虫病防治杂志
- 主办单位：中华人民共和国卫生部
- 国际刊号：11-5457/R
- 国内刊号：11-5457/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：中华预防医学会、系列杂志优秀期刊期刊收录：上海图书馆馆藏, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中), 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 万方收录(中), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版)
5种高危型HPVE7蛋白B细胞表位的预测
尹小丽；王学政；代运章；张士娥；朱有名；鲁艳芹；韩金祥
关键词：人乳头瘤病毒, E7蛋白, B细胞表位, 比对, 预测
摘要：目的 预测并分析我国人群常见人乳头瘤病毒HPV16、18、33、52与58亚型E7蛋白的线性B细胞表位.方法 在NCBI数据库中获取5种高危型HPVE7蛋白氨基酸序列,采用ClustalX2软件进行多序列比对;运用ExPASY服务器SOPMA和GOR4法预测二级结构,采用Kyte-Doolittle方案和Hopp-Wood方案预测亲水性;运用Bepipred和ABCpred软件预测B细胞表位,辅以抗原性指数,综合评判几率较大的B细胞优势表位. 结果 综合多参数分析,5种HPV亚型的B细胞表位均集中在蛋白质的N端2-50位附近,其中预测的HPV16与52亚型的第16-21位氨基酸序列一致性为100％,均为QPETTD;HPV16型第28-41位(LNDSSEEEDEIDGP)与HPV52型第28-38位(LGDSS-DEEDTD)的氨基酸序列一致性为78％;HPV16型第42-50位(AGQADEPRA),HPV33型第31-46位(SSDEDE-GLDRP),HPV52型第36-46位(DTDGVDRPDGQ)和HPV58型第73-78位(TTTDVR)为各自的特异B细胞表位.结论 生物信息学方法预测5种HPV的B细胞表位均集中在蛋白质的N端2-50位附近,同时具有特异的B细胞表位(18型除外),可为宫颈癌的诊断、预防和新型疫苗的研制提供参考.
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