期刊简介

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  • 杂志名称:中国病原生物学杂志
  • 主管单位:中国寄生虫病防治杂志
  • 主办单位:中华人民共和国卫生部
  • 国际刊号:11-5457/R
  • 国内刊号:11-5457/R
  • 出版周期:月刊
期刊荣誉:中华预防医学会、系列杂志优秀期刊期刊收录:上海图书馆馆藏, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中), 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 万方收录(中), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版)
中国病原生物学杂志2018年第08期

2009-2016年石家庄市甲型H1N1流感病毒血凝素基因特征分析

赵冬;史艳;刘维华;李秀娟;田会方;高伟利

关键词:甲型H1N1流感病毒, 血凝素, 基因特征
摘要:目的 分析石家庄市2009-2016年甲型H1N1流感病毒分离株血凝索蛋白(HA)的基因特征,了解其变异情况. 方法 选取石家庄市2009-2016年甲型H1N1流感病毒分离株71株,PCR扩增HA基因并测序;利用生物信息学软件对分离株的HA基因进行进化和变异分析,并与北半球疫苗株A/California/07 /2009进行对比;采用MEGA(5.05)软件NJ法构建进化树,进行系统进化分析. 结果 石家庄市71株分离株与疫苗株A/California/07/2009的HA基因核苷酸同源性为96.86%~99.57%,氨基酸同源性为96.77%~99.11%,株间核苷酸同源性为96.30%-100.00%,氨基酸同源性为96.95%-100.00%;进化树分为2支,部分2013年分离株及2014年和2016年分离株与疫苗株发生偏离;与A/California/07/2009相比,分离株HA蛋白有7处抗原位点和4个受体结合位点发生变异,NetNGlyc1.0预测8个糖基化位点均未发生缺失,2016年的4个分离株在162位新增一个糖基化位点. 结论 石家庄市甲型H1N1流感病毒分离株HA基因与疫苗株同源性逐年降低,氨基酸变异逐年增多,虽显示低致病性特征,但仍需继续对其加强监测.